此书为明万历庚子年，即万历二十八年（1600）福建闽格古斋的刻本，由郑煾主持校刻，书牌题 “萬曆庚子校刻，閩格古齋藏板”，是明代后期《山海经》郭璞注体系当中重要的闽地刻本，此完整十八卷，卷首保留郭璞所作《山海经序》，序文之后载全书总目，厘定为南山经第一直至海内经第十八，合计十八卷，完整承袭东晋郭璞的注释文本，经文与郭璞的注解相互配属，注解以小字随经文附列，体例完备。
原典《山海经》成书并非出自一时一人之手，一般认为《五藏山经》成书于战国时期，《海经》各篇杂糅秦汉时期的内容，全书以山川地理为框架，记录各地山岳河川、金石草木、奇禽异兽、神灵巫祝、异域方国，混杂上古神话、民俗信仰、远古地理见闻，保存大量上古时期的传说素材。东晋郭璞为全书作注，疏通古字古音，考辨风物地名，兼做阐发议论，又撰图赞，是流传后世最核心的古注本，后世研读《山海经》大多以郭璞注作为基础文本依据。
此万历闽格古斋本，属于明代福建建阳刻书风气下产出的本子，字体为晚明闽刻典型的方体刊字，大字书写经文，郭璞注释以小字双行排布，版式规整。卷首郭璞序言完整保留，序中议论世人疑惑《山海经》闳诞诡怪，以庄子 “人之所知，莫若其所不知” 立论，阐释此书价值，完整保存郭璞原始序论。总目完整罗列十八卷次第，五篇山经居前，海经、大荒诸经、海内经依次接续，和后世通行十八卷篇目次序完全一致。正文开篇自《南山经》鹊山开始，逐山记述方位、物产、神祇，遇生僻字随文附音切训释，将郭璞的音释、训诂全部收纳，校勘上对前代版本文字多有参订，是明代流传很广的郭注通行本，清代郝懿行撰写《山海经笺疏之时，也将此本用作重要参校版本之一。
该本传世实物，重要藏本见于日本内阁文库，书册带有旧藏朱印，原书纸本历经岁月，部分书页有修补痕迹，书内钤盖多方古代藏书印章，见证递藏源流。明代是《山海经》刊刻传播十分兴盛的阶段，除吴琯等多种刻本之外，这部闽格古斋本，代表福建地区对上古奇书的整理刊刻成果，既保留晋代古注的文本面貌，又体现晚明闽地刻书的工艺特点，对于研究《山海经》版本流变、郭璞注的传承、明代神话古籍刊刻，都具备很高的文献版本价值。全书不附带版画，专重经注文本，以传录文字训诂为核心，和明代其他带图像的山海经刊本形成区分，是纯粹的文字校刻本，方便研读经文与古注，在东亚地区也有流传，是海外汉籍当中十分受重视的明刻《山海经》版本。